用户和支付宝协商支付宝延期还款三年的流程如下：

1、用户主动和支付宝客服取得联系；

2、用户和支付宝客服说明自己的实际情况，例如自己手头不宽裕等等，用户还可以提供有关的资料证明自己当下没有还款能力，然后向支付宝客服提出想延期三年还款的请求；

3、然后等待支付宝客服答复，如果支付宝平台同意延期三年还款，就是协商成功了；

4、用户制定还款计划，按时进行还款。