如果用户发现贷款软件扣取了会员费，那么用户可以通过以下方式尝试追回会员费：

1、用户可以联系贷款软件的工作人员，了解扣除会员费的具体情况，和工作人员进行协商，让贷款平台退回会员费；

2、如果用户和贷款平台协商不成功，那么用户可以前往派出所报案，让警察帮助自己追回会员费，报案时要尽可能提供详尽的证据；

3、用户也可以到法院进行上诉，上诉期间要搜集贷款软件扣费的相关证据。