机票增值税抵扣税额计算如下：

持航空运输电子客票行程单能抵扣的进项税额等于(票价加上燃油附加费)除以(1加9%)乘以9%。

持增值税专用发票和增值税电子普通发票按发票上注明的税额抵扣进项税额。

持注明旅客身份信息的铁路车票可抵扣的进项税额等于票面金额除以(1加9%)乘以9%。

持注明旅客身份信息的公路、水路等客票可抵扣的进项税额等于票面金额除以(1加3%)乘以3%。