支付职工困难补助的会计分录分为以下两种情况：

1、如果执行新会计准则：

计提时：

借：管理费用——职工福利费；

贷：应付职工薪酬——职工福利费。

支付时：

借：应付职工薪酬——职工福利费；

贷：库存现金。

2、如果没有执行新会计准则，那么直接计入管理费用：

借：管理费用——职工福利费；

贷：库存现金。

职工的生活困难补助是职工福利费的一部分，职工福利费是指用于增进职工物质利益，帮助职工以及其家属解决一些特殊困难以及兴办集体福利事业所支付的费用。